江戸時代始め、福岡藩初代藩主黒田長政のもとには、武士を辞め京都や上方の進んだ技術を学んだ医師が知行を与えられ召し抱えられました。その後も福岡藩には、長崎でオランダ外科を学んだ医師も召し抱えられています。江戸時代の中頃以降は、新規採用や分家によって、俸禄・扶持をうける医師も増え、藩医として約120人の医師がいました。医術の専門化も進み、本道（内科）、外療（外科）、や小児、産、眼、口（歯）など各科が見られます。
　藩主の侍医には、世襲する高禄の知行の医家や、俸禄・扶持を受ける医家からベテランや良医が抜擢され、20人前後の医師団となっていました。彼らは福岡城内や江戸藩邸で、藩主や家族の日常の医療を受け持ち、藩主の参勤交代や、長崎警備にも付き添います。その他の医家も、城下町での実地医療や、塾や他国修業で、医術の研鑽にはげみました。
　江戸時代の終わりから幕末、藩は、種痘などさらに進んだ西洋医学を学んだ医師を登用しはじめ、藩主や領内の医療行政にも活動の機会を与えています。